Originaire de Nyon, Jean Gaudin, né le 18 mars 1766 à Longirod suit le Collège de Genève (1781), puis étudie la théologie à l'Université de Zurich. C'est pendant ce séjour, à l'occasion de plusieurs excursions dans les environs de la ville, que serait né son goût pour la botanique. En mai 1789, il promet d'épouser celle avec qui il aura deux filles, Anna-Barbara, fille de J.-J. Escher, bailli de Sax (SG) et de Anna-Barbara née Hirzel.

Jean Gaudin publie Agrostologia helvetica (1811), à savoir une description des graminés, qui contribue à son rayonnement international. Il est nommé professeur honoraire de botanique à l'Académie de Lausanne en octobre 1820. De 1828 à 1833, il publie une remarquable Flora helvetica, complétée en 1836 par son élève Jean-Pierre Monnard. Hors Académie, il est maître de mathématiques et d'histoire naturelle à l'Institut Snell à Nyon, dont il devient co-directeur, puis directeur à la mort d'Auguste Snell (1810).

Membre fondateur, avec Henri-Albert Gosse, de la Société helvétique des sciences naturelles (dès 1815), il est également le premier président de la Société évangélique des missions à Nyon (dès 1826). Jean Gaudin occupe successivement la charge ecclésiastique de pasteur à l'Eglise allemande de Nyon (ministre de 1795-1817), à Longirod (1817-1821), puis à Nyon (1821-1833).

Jean Gaudin meurt le 14 juillet 1833 à Nyon d'une fluxion de poitrine. Son herbier, de grande valeur scientifique, est finalement remis au Musée botanique cantonal de Lausanne en 1878.

Marc Kiener, sous la direction d'Olivier Robert, Dictionnaire des professeurs de l'Académie de Lausanne (1537-1890), p. 296-297; P.-E. Pilet Dictionnaire historique de la Suisse; Jean-Louis Moret Journal d'une excursion à la Vallée de Joux et dans les Montagnes neuchâteloises, en 1813 : un manuscrit inédit du botaniste vaudois Jean Gaudin In: Bulletin de la Société vaudoise des sciences naturelles. - Lausanne. - Vol. 80(1990), fasc. 1, p. 1-47 [BCU07/Doc.vaudoise/bs/2011/05]

1878: l'herbier de grande valeur scientifique de Jean Gaudin est remis au Musée botanique cantonal de Lausanne Consulter une coupure de presse relative à Jean François Aimé Philippe Gaudin dans les Archives du Temps.